Origen del SARS-CoV-2 y secuencias genéticas
26/09/2021
Origen del SARS-CoV-2 y secuencias genéticas
26 de septiembre de 2021
El origen de la pandemia de COVID-19 tiene fecha: diciembre de 2019. Sin embargo, el origen del SARS-CoV-2 sigue siendo desconocido. Pero hay consenso científico en la teoría de la zoonosis: el virus viene de un animal. Óscar González-Recio, experto en Genómica, ha analizado recientemente los datos del último artículo científico sobre ello publicado por un grupo de la Universidad de California.
Nuevas investigaciones apoyan el origen zoonótico del #SARSCoV2, con varios contagios independientes al inicio de la pandemia#abrohilo👇
— Oscar Gonzalez-Recio 🧬 (@OscarGenomics) September 25, 2021
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Posibles orígenes del SARS-CoV-2
Vamos a analizar qué datos ha encontrado el artículo. Los científicos estudian si el SARS-CoV-2 muestra un origen o varios. Que tenga un único origen apoyaría teorías como que el virus se escapó de un laboratorio. Si hay varios orígenes, es más probable que hubiera un hospedador intermediario que contagió en distintos lugares. En este sentido, al inicio de la pandemia se establecieron dos linajes: A y B. El linaje B se ha convertido en dominante en todo el planeta, y está asociado al mercado húmedo de Huanan (Wuhan). El linaje A está asociado a contagios en China, pero a mercados diferentes. Estos datos apoyan la hipótesis de la zoonosis desde un hospedador intermediario.
Sin embargo, muestras de principios de 2020 con elementos comunes entre ambos linajes indicarían que un linaje proviene de otro. Es decir, se volvería a apostar por el origen único y teorías como el escape de un laboratorio. Para confirmar esto, los científicos analizan la calidad de la secuenciación genética de dichas muestras. Una baja calidad en las técnicas usadas en su momento podría justificar que se hubieran obtenido secuencias genéticas falsas. Los autores del artículo concluyen que, en efecto, las secuencias podrían ser un artefacto técnico. Lo mismo opina el genetista Óscar González-Recio tras analizar por sí mismo los datos.
... se secuenció con tecnología de nanoporos, y no se conoce ni la profundidad de secuenciación ni el método de ensamblaje. Otra de las secuencias, EPI_ISL_437614 procedente de una persona de Tailandia (25 de febrero de 2020, sin otros datos) se secuenció con tecnología...
— Oscar Gonzalez-Recio 🧬 (@OscarGenomics) September 25, 2021
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Otras secuencias tomadas en Japón, en el crucero Diamond Princess y también en España apoyarían la via de la aparición independiente de los linajes A y B, y por tanto
— Oscar Gonzalez-Recio 🧬 (@OscarGenomics) September 25, 2021
⚠️‼️ATENCIÓN ‼️⚠️
eliminarían la posibilidad de una FUGA de laboratorio.
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Conclusiones
Sigue dominando la teoría de la zoonosis como explicación más probable para el origen del SARS-CoV-2. Siguen existiendo otras teorías sobre el origen del coronavirus SARS-CoV-2, como aquellos mineros con signos de COVID-19 en 2012. Aunque aún no se ha identificado, eso sí, al hospedador intermedio o la fuente origen de la enfermedad. Los datos apuntan, como se ha visto, a un origen múltiple en diversos lugares.
Óscar González-Recio es investigador científico en el INIA-CSIC. Es especialista en Genómica y profesor asociado en la Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica, Alimentaria y de Biosistemas (Universidad Politécnica de Madrid).